临床上对于肛门脓肿的治疗，主要是采取肛周脓肿根治术或者是肛周脓肿切开引流术。在手术的过程中，清除干净感染的肛门组织以及内口，同时术后选择高锰酸钾溶液、肛门洗剂、红油膏纱条等药物进行换药处理。而且一定要注意肛周部位的干燥卫生，饮食方面要注意清淡，适当的配合抗生素进行消炎抗感染处理。