怀孕三周如果孩子不想要，可以吃药流产，也可以做人流手术。并且两者各自的副作用也不一样。药物流产容易流产不全，以及有大出血的风险；而人流手术属于有创操作，容易对子宫内膜造成伤害，而且可能是永久性的，比如子宫内膜变薄，宫腔黏连等，这些都会影响以后怀孕，因此需要自己选择合适流产方式。但是不管是选择哪种流产方式，都需要先做彩超检查，排除宫外孕。