生理性的可以见于过度的手淫或者是性生活，导致了阴茎和尿道的劳损，患者就会出现一过性的勃起疼痛，还有排尿时候的烧灼感以及射精痛，这种只需要降低性生活或者手淫的频率，多休息一段时间就可以自行缓解。第二种就是有考虑阴茎海绵体硬结症，这是一种阴茎海绵体进行性纤维化的疾病，表现成在整个阴茎的根部，或者是其他部分可以触及珍珠样大小的硬结，边界还比较清楚，质地坚硬，触痛明显，不太容易推动，而且这些结节在勃起的时候疼痛更加明显。这种治疗起来相对困难，一般采用局部的激素注射或者是体外冲击波松解，但是整体而言治疗效果并不是太好，只能相对控制，并不能完全缓解。然后少数还可以由于一些不洁性行为病史，所导致的性传播疾病，这种情况就需要到皮肤性病科去专门排查。