亚急性甲状腺炎的治疗包括两个方面，包括减轻局部症状和针对甲状腺功能异常进行治疗。大多数的患者对症治疗即可痊愈，一般预后良好，不会留下后遗症。少数病人会有复发，表现为甲状腺不明显的缩小，或者缩小后又增大，有可能会出现甲状腺功能的异常。药物治疗包括以下几个方面：第一、对于轻型的病例，采用阿司匹林或其他止痛药物进行对症治疗。第二、病情严重的患者，出现明显的疼痛、明显的发热，短期内可用糖皮质激素，如泼尼松，可以迅速缓解临床表现。第三、β受体阻滞剂可以用于甲状腺毒症患者。患者心率明显增快，可以用β受体阻滞剂对症治疗。第四、甲状腺激素用于甲状腺功能明显减低者，可短期小量使用；如果出现永久性甲状腺机能减退，可以长期替代治疗。