导致眼睛磨痛的病因很多，一般需要专业的眼科大夫鉴别诊断，建议及时到医院治疗。一般情况下，眼睛磨痛可能有以下原因：1.结膜炎。结膜炎时，眼睑或者结膜会出现乳头、滤泡增生，由于角膜富含神经，会感觉到磨痛、异物感。2.结膜结石。如果结膜炎治疗不及时，会造成坏死的细胞钙化形成结石，使患者出现角膜磨痛的症状。3.倒睫。倒睫是指眼睫毛生长不规则，扎向眼球，使眼睛出现刺痛和异物感。4.眼内异物。如果有异物崩到眼睛里，也会产生磨痛的情况。5.当睑板腺开口堵塞的时候，也会产生眼内异物感的症状。