男性生殖器上面小腹疼是急性膀胱炎、膀胱结石导致的。急性膀胱炎是男性不注重个人清洁卫生导致尿道口受到病菌的滋生、感染，病菌会上行感染至膀胱造成急性膀胱炎症，炎症会刺激到膀胱内部组织，从而出现尿频、尿痛、小腹疼痛。膀胱结石也会导致男性生殖器上方的小腹发生疼痛，由于病菌的感染、尿路梗阻、营养不良引发膀胱结石，在排尿时膀胱中较小的结石会混在尿液中。在尿液经过狭窄的尿道会卡在尿道，从而形成梗阻堵塞，导致剧烈的排尿痛，疼痛会放射至腹部疼痛，就会让患者产生生殖器上方的小腹的疼痛感。