龟头上有白色小颗粒原因如下：一、阴茎珍珠疹，是一种良性病变，通常为不注意生理卫生所引起，一般没有临床症状，主要出现于冠状沟周围，也不需要进行特殊治疗。二、生殖器疱疹，通常为不洁性生活引起，在早期会有白色巧克力，随着病变加重会导致小颗粒变成红色，并且呈菜花状，还伴有明显刺痛和渗出。