40天婴儿拉肚子，首先要查明一下婴儿拉肚子的原因是什么，然后进行对因治疗和对症治疗。引起婴儿拉肚子有感染性和非感染性因素，感染性因素方面常见的有细菌感染和病毒感染，如果是细菌感染，就要给予抗生素治疗。如果是病毒感染，目前没有针对抗病毒的特效药物，但是它有自限性，予以对症处理就好了。非感染性因素的常见的有饮食不当，给宝宝吃的东西太多、太杂，或者给宝宝太早添加了辅食，超过了宝宝自身的消化能力。这时候就要调整饮食，不要给宝宝吃太多的食物，40天的婴儿以乳类为主，不要添加其他的辅食。还有的宝宝拉肚子，是对乳类当中的蛋白过敏，这时候要更换成氨基酸奶粉喂养。另外，拉肚子的时候还可以给予对症治疗，可以口服保护胃肠黏膜的药物，如蒙脱石散。还有口服调节肠道菌群的药物益生菌等。