肛门长了一个肉疙瘩，有疼痛，患者可以通过药物治疗或者手术治疗方法处理，具体如下：1、药物治疗：患者可以口服地奥司明，外用痔疮膏，配合中药坐浴等等综合治疗方法缓解症状；2、手术治疗：如果患者经以上用药治疗症状仍然无法缓解，比较严重的情况下需要考虑行手术治疗。肛门长了一个肉疙瘩，有疼痛，应首先考虑是血栓性外痔或者炎性外痔，其中血栓性外痔是由于外痔内血管破裂，血液淤积于皮下形成血栓或者血管内血栓形成所导致，会伴有肛门局部剧烈的疼痛症状，表面呈紫黑色，而炎性外痔是由于外痔出现炎性水肿所导致。