肾囊肿会引起疼痛的临床症状，肾囊肿在临床上分为单纯性肾囊肿和多囊肾，具体分析如下：一、单纯性肾囊肿：临床症状往往是侧腹部或者是背部出现疼痛的症状，并且可以伴有镜下血尿，但是大多数患者在早期可能没有明显症状，只是在体检时发现有肾囊肿。二、多囊肾：属于常染色体显性遗传疾病，其主要的临床症状大多在40岁左右才出现，主要表现为疼痛、腹部肿块、肾功能损害。如果伴有结石或者尿路感染的患者，可以出现血尿、脓尿、发热以及肾区疼痛的相应症状，并且1/3的多囊肾患者可能有肝囊肿，但是肝功能一般没有明显的变化。