双肾结石与右肾囊肿治疗的方法如下：1、对于较小的双肾结石，直径小于0.8厘米以下，如果没有明显的临床症状，没有感染和肾功能损害的情况下，可以采取中西医结合的方法进行治疗，比如可以使用排石颗粒、多饮水，做跳跃性的运动等等；对于直径大于0.8厘米以上的结石，可以选择体外震波碎石术，或者腔内泌尿外科或者开放手术治疗。2、一般对于较小的右肾囊肿主要是长期随访和观察，不需要药物治疗，也不限制患者的活动，当囊肿直径大于4厘米以上时，可以选择囊肿穿刺术或者腹腔镜手术治疗。