男性的阴茎根部如果长有痘痘可以通过涂抹药膏、局部热敷或者自行消退的方式进行治疗。一般考虑可能是由于阴茎的根部出现了湿疹引起的，这种情况下可能是由于男性阴茎根部的毛囊比较丰富、局部比较潮湿不容易散热，从而出现了长痘痘的情况。首先应该要注意保持外阴部的清洁卫生、注意散热，可以在阴茎根部表面涂抹抗湿疹的药物，比如炉甘石液进行涂抹，一般能够得到好转。如果阴茎根部长有痘痘比较柔软且触摸也没有疼痛感可能是局部长有囊肿，这种情况下一般建议囊肿自行吸收，如果发现痘痘在逐渐增大可以考虑行微创手术进行切除。