曲霉菌广泛的存在于自然界中，因此粉尘多的环境里可以感染曲霉菌。另外，脱谷粒时谷粒飞入眼睛里，也容易造成角膜的损伤，感染曲霉菌。眼部皮肤等外伤也容易污染到曲霉菌，手术的器械也容易被真菌感染，慢性的疾病比如肺结核、慢性支气管炎、支气管哮喘、支气管扩张等疾病，也容易感染曲霉菌。治疗耳朵的曲霉菌病，可以用硼酸或醋酸铝对耳垢轻轻擦洗，然后用2%的龙胆紫涂擦，或者滴入克霉唑进行涂擦。眼部的曲霉菌的溃疡可以用金褐霉素溶液或软膏涂擦，另外也可以用两性霉素B的溶液或眼膏进行外涂。呼吸道的曲霉菌病可以用两性霉素B进行喷雾治疗。如果是肺部以及其他声部的曲霉菌病，尤其是曲霉菌引起的败血症，可以采用全身治疗为主，可以用两性霉素B，或者球红霉素或者大蒜素静滴，同时还要口服5-氟尿嘧啶或者克霉唑等治疗。