病毒疣可以采用药物、物理等方法来进行治疗。物理治疗的方法有激光、冷冻、电灼、微波等；如果疣体比较大，还可以采取手术切除；也可以使用外用药物进行局部涂擦治疗，常用的药物有咪喹莫特乳膏、氟尿嘧啶软膏、干扰素喷雾剂、鬼臼毒素酊等；对于反复发作者，还可以口服药物治疗，一般选用免疫调节药物，如：胸腺肽或者转移因子。以上所提到的药物，需要在当地医生的指导下使用。