牙齿根部发黑，可能有以下两个原因导致：第一、外源性染色，也就是牙齿上面有菌斑堆积，比如吸烟造成烟斑堆积，喝中药造成色素沉着在牙根上面。喜欢喝有色素的饮料、咖啡、浓茶，同样也会导致菌斑、色素堆积在牙根的表面导致牙根发黑。需要到医院进行牙齿洁治，也就是洗牙，可以将牙齿重新清洁干净。第二、因为牙根龋坏造成的发黑，需要到医院进行龋齿治疗，才能使发黑的现象得到解决。