男性小便刺痛的原因不同，所采取的治疗方法也会有所差异，常见的治疗措施主要如下：1.药物治疗药物主要包括非甾体消炎类药物、抗生素类药物等，对于疼痛症状比较明显者，可给予消炎镇痛类药物，能有效的缓解平滑肌痉挛，起到较好的止痛效果。对于泌尿系感染者需要根据药敏试验的相关结果，给予有效的抗生素类药物。2.放射治疗如果是由泌尿系恶性肿瘤所引起的小便刺痛，通常需要采取放疗的方法缓解临床症状。3.手术治疗对于因尿路结石所引起的小便刺痛，可采取碎石手术，比较常见的手术包括体外波冲击碎石术、输尿管镜取石碎石术等。