肺部感染的致病因素很多，包括病原菌的数量、呼吸道局部和全身免疫系统的防御等，各种病原体可以通过吸入空气、血液传播、支气管传播等感染方式进入肺部。引起感染较为常见的病因有细菌，例如肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌、肺炎克雷伯菌、病毒有冠状病毒、腺病毒、流感病毒，还包括有结核菌感染、真菌感染、寄生虫感染以及其它非典型病原体的感染，包括军团菌、支原体抗体、衣原体感染等。