对于肛门囊肿具体治疗，最常见的还是以手术治疗为主，做小手术切除能够有效从根本上去除囊肿，对于囊肿的恢复具有较好的作用。此外，还需保持清洁干燥以及注意不要吃辛辣刺激的食物，上厕所时间短一点都能有效改善和预防囊肿的复发，必要时还可以口服抗生素预防感染。