强直性脊柱炎早期通过合理规范的治疗，可以达到疾病的完全缓解。强直性脊柱炎是一种慢性疾病，少数患者可以出现自发缓解，大多数轻度活动的中轴型强直性脊柱炎，患者受累范围很小，可维持几乎全部的功能和就业能力。只有小部分患者可能会出现严重的关节变形，甚至危及生命的肌肉骨骼系统外并发症。提示预后不良的因素，包括髋关节炎、腊肠指和腊肠趾、非甾体抗炎药疗效差、炎症指标一直较高、腰椎活动度受限、寡关节炎、16岁以前发病，这些都提示可能预后较差。