肝管结石又称为肝内胆管结石，无症状的肝管结石可以不治疗，仅定期观察随访即可。临床症状反复发作者，应该手术治疗，这条原则为尽可能取净结石解除胆道狭窄及梗阻，除结石部位和感染病灶，和建立通畅的胆汁引流，防止结石的复发，手术方法包括：第一，胆管切开取石术，最基本的方法并争取切开狭窄的部位，延胆总管向上切开甚至可达二级胆管，直视下或者通过术中胆道镜取出结石直至取镜。第二，胆肠吻合术，不能作为替代对胆管狭窄结石病到的处理方法，当奥狄括约肌仍有功能时应尽量避免行胆肠吻合术。第三，肝切除术，肝内胆管结石反复发作并发感染引起局部得肝萎缩纤维化和功能丧失，切除病变部分的肝，包括结石和感染的病灶，不能切开的狭窄胆管区除了结石的在发源地，并可防止病变肝段和肝叶的癌变，是治疗肝内胆管结石的积极的方法。