甲状腺抗体主要包括甲状腺过氧化物酶抗体、甲状腺球蛋白抗体、促甲状腺素受体抗体，其中甲状腺过氧化物酶抗体和甲状腺球蛋白抗体是确定原发性甲减病因和诊断自身免疫性甲状腺炎包括桥本甲状腺炎，萎缩性甲状腺炎的主要指标。一般认为甲状腺过氧化物酶抗体对自身免疫性甲状腺炎的意义较为肯定。如果是甲状腺过氧化酶抗体，甲状腺球蛋白抗体阳性伴血清的促甲状腺素水平升高，说明甲状腺细胞已经发生损伤。另外，促甲状腺素受体抗体高，一般提示是Graves病的可能。