治疗鹅口疮需要选择积极的抗真菌药物，避免使用些广谱抗生素或糖皮质激素，否则有可能会加重真菌感染。在临床用药的选择方面，一般可选择2%~5%的碳酸氢钠溶液，如果是在哺乳期的婴儿一定要注意在哺乳前后要清洗口腔，清洗乳头以及奶瓶，对婴幼儿的餐具或生活用品要注意隔离和消毒，在口腔粘膜存在病变较广泛时，可涂抹制霉菌素，此外还需积极加强营养，特别是适当的补充维生素B2和维生素C。