阴茎疼痛，一般和阴茎皮肤组织感染，阴茎海绵体阴茎软组织感染，或者阴茎外伤，导致阴茎皮肤黏膜或者阴茎海绵体水肿充血有关。首先，如果阴茎皮肤和阴茎海绵体软组织受到致病菌侵犯时，会导致这些组织发生炎性病变，使这些组织黏膜处于充血状态，这时就会导致阴茎疼痛，多半会伴随着不同程度的阴茎肿胀和瘙痒症状。另外，阴茎受到外伤时，会导致阴茎海绵体充血，这时会压迫阴茎神经，从而导致阴茎疼痛，一般会伴随着明显的阴茎充血现象。建议做阴茎超声检查，和阴茎皮肤黏膜分泌物检查，明确具体病因。