慢性角膜炎很难治疗，其主要是由真菌感染引起，或者是急性细菌性角膜炎、病毒性角膜炎迁延不愈转化而来，成为慢性的角膜炎。其治疗有以下几点：一、抗细菌治疗 病因不明确时，首选广谱抗生素如妥布霉素、庆大霉素，待药敏实验出来之后，再选用敏感抗生素进行治疗。二、抗真菌药物 可选用多烯类、咪唑类抗真菌药。三、抗病毒药物 可选用阿昔洛韦眼药水、更昔洛韦眼用凝胶等等。四、抗阿米巴药物 阿米巴感染引起的角膜炎治疗比较棘手，常用羟乙醛酸、丙氧苯咪、新霉素以及抗真菌药物进行治疗。五、糖皮质激素的应用 糖皮质激素具有抗炎、减少新生血管以及疤痕的功效，但是容易影响上皮的愈合和创口的修复，促使病毒和真菌感染以及全身副作用，应该谨慎使用。六、散瞳 可以减轻虹膜的刺激反应，在一定程度上减少穿孔时发生虹膜前粘连的风险。七、手术治疗 炎症消退后留下疤痕，可以进行角膜移植术或准分子激光治疗。