同房后第二天龟头刺痛有可能是炎症导致。男性患有包皮龟头炎，或者女性患有阴道炎，同房时会造成炎症相互传染，从而造成龟头疼痛。患者可以使用药物进行治疗，比如黄柏洗液等。同时要注意个人卫生、勤换洗内裤，多喝水，勤排尿。另外，还有可能是同房过程中用力过大，导致组织损伤引起。只要注意休息，一般很快都会康复。建议患者如果出现同房后第二天龟头刺痛，应该及早去医院泌尿外科进行就诊，找到原因之后再对症治疗。