下丘脑垂体性月经失调可以服用性激素的药物进行治疗。下丘脑垂体性月经失调是由于性激素水平紊乱引起的，可以先到医院化验性激素水平，明确诊断之后在医师的指导下服用相关的药物治疗。临床常用的药物有补佳乐和黄体酮。也可以考虑服用复方短效避孕药进行对症治疗，疗程相对较长，可能需要服用36个月。西药治疗期间也可以配合服用有益肾填精、活血调经作用的中药治疗。平时饮食上要适当的多吃高蛋白类的食物，如鸡蛋、瘦肉、牛奶等，饮食要全面、多元化。