肝囊肿穿刺的后遗症主要是复发、腹胀、腹膜炎等。临床上肝囊肿是一个常见疾病，大部分的肝囊肿较小时不需治疗。肝囊肿增加到一定程度时可以行穿刺治疗，也可以行肝囊肿去顶开窗术，各有各的利弊。肝囊肿穿刺操作相对简单，在B超引导下可以将肝囊肿内液体抽出，并且向内注射硬化剂。肝囊肿穿刺后主要容易引起复发，且在短时间内很容易出现复发。如果剩余囊液通过穿刺部位流入到腹腔内，有引起腹膜炎的可能。