肛肠囊肿就是平时说的肛周脓肿，它主要是因为肛腺感染沿着直肠或者肛管蔓延。肛周脓肿的治疗早期最好切开引流，这是控制感染的关键。如果症状不是特别明显，脓肿形成不是特别彻底，也可以采取非手术治疗，比如口服中成药仙方活命饮起到清热解毒，消肿止痛的作用，或者在脓肿的中期也可以口服透脓散起到透脓托毒的作用，还可以口服青蒿鳖甲汤祛湿解毒。如果脓肿形成，应当尽快地行肛周脓肿切开引流术，做一个彻底的手术，可以控制感染，防止感染蔓延形成感染性休克。术后给予止疼，然后温盐水坐浴促进肛周的清洁以及血液循环。