一般的治疗可以按照呼吸道疾病的隔离方式，给予疾病的隔离，保持空气的新鲜，避免各种刺激，食物选择既要讲究营养，又要容易消化吸收，平时加强护理、保障休息、预防并发症。第二个治疗方法就是用抗生素治疗，百日咳菌对大环内脂类抗生素比较敏感，早期治疗便于缩短病程、减轻症状，一般的疗程为两周左右。再有对症治疗主要是祛痰止咳，口服和静脉注射低盐氨溴索，咳嗽激烈的可以用沙丁胺醇口服，再有就是要注意休息、改善低氧血症。