真菌感染患者可以通过直接镜检方法进行检查，比如在病变部位采集标本，主要包括皮肤鳞屑、结痂部位菌痂，有化脓感染患者直接取脓液或者渗出物作为标本，把采集好标本进行专业化处理以后在纤维镜底下进行观察，如果发现菌丝和孢子，经过高倍镜证实就可以确诊真菌感染。