病人患有尿道口痛原因有很多，男性生殖及泌尿系发炎，比如：龟头炎、尿道炎、肾盂肾炎、前列腺炎、膀胱炎等等，都可以引起病人尿道口痛。结石可引起病人尿道口痛，比如：膀胱结石疼痛可放射至尿道口，另外还有尿道结石也可引起尿道口痛。创伤如骑跨伤、经尿道侵入性操作，也可引起尿道口痛，尿道癌，也可导致尿道口痛。