胃肠道的间质瘤发病原因是比较多的，其中环境因素占得比较高，大约占到40%，是比较重要的一种。其病因与各个地方的饮食习惯密切相关，经常食用霉变、腌制、熏烤等食物，或者过多摄入食盐，都可能增加发生胃肠间质瘤的风险。腌制的鱼肉还有很多的化合物质，而发霉的食物含有很多的真菌，腌制的食物中有亚硝酸盐类，这些都有致癌作用。另外，胃肠间质瘤的病因也与遗传有关，患者亲属中患胃肠间质瘤的人，往往发病率会比正常人的高。这些人可能是由于生活环境与饮食习惯相似，增加了胃肠间质瘤的发病机会。所以如果得了胃肠间质瘤以后，建议到专科医院就诊进行治疗。