孕妇生殖器沙眼衣原体阳性可以选择药物治疗，首选阿奇霉素或者阿莫西林。并不推荐使用红霉素。孕妇是禁止使用多西环素、喹诺酮类和四环素的。另外，性伴侣还需要同时的进行治疗。若可能感染到新生儿，也要及时的进行治疗。沙眼衣原体感染是比较常见的妊娠期性传播疾病，主要感染柱状上皮及移行上皮而不向深层侵犯，主要通过性接触进行传播，间接传播比较少见。孕妇感染后可发生宫内感染，通过产道感染或者出生后感染新生儿。其中，经产道感染是最主要的传播途径。孕妇感染后大多没有症状或者症状轻微。其中，衣原体的培养是诊断的金标准。