常规痰抗酸染色镜检阳性率为4.3%～68.8%，多数报道在30%以下。痰结核分枝杆菌培养阳性率10.7%～100%，儿童胃液结核分枝杆菌培养阳性率较高。细菌学检查阳性率不高的原因可能是多方面的，如引流支气管不通畅、含有结核分枝杆菌的坏死物不易排出体外、或毛刷不易刷到结核性分泌物、痰含菌量少、病灶为粘膜下浸润、增殖病灶处于相对静止状态、病例选择和检测方法不同等。采用毛刷涂片、支气管冲洗液涂片培养、术后痰涂片均是痰细菌学检查的良好补充。不同采样标本，不同检测方法联合应用可提高阳性检出率。