儿童的扁平疣主要采取一些物理治疗，或者是使用抗病毒的药物来进行治疗。儿童的扁平疣它是由人乳头瘤病毒，也叫HPV病毒感染所引起来的。如果扁平疣数量不多，首先可以采取一些物理疗法，比如局部实行液氮冷冻、二氧化碳激光、电离子灼烧等等。如果扁平疣的数量比较多，也可以先用一些药物治疗，包括使用一些外用药，维A酸乳膏、阿达帕林凝胶、氟尿嘧啶软膏、咪喹莫特，还有像干扰素凝胶等等。另外，还可以配合内服一些能够调节机体免疫功能的药物，比如胸腺肽、左旋咪唑，还可以考虑肌肉注射像斯奇康等等，来刺激机体的免疫力。特别顽固的扁平疣，还可以考虑做扁平疣的自体埋植术来进行治疗。