溃疡性结肠炎的病因还不是非常明确，目前认为溃疡性结肠炎的病因可能包括以下几个方面。第一，免疫因素，各种因素造成炎症因子的分泌增多，导致肠黏膜的持续性损害，从而诱发溃疡性结肠炎。第二，遗传学因素。不少研究表明溃疡性结肠炎具有家族聚集倾向。第三，肠道微生态失调，特别是肠道内益生菌群的紊乱，可能会影响肠道内环境，特别是使用抗生素或免疫抑制剂治疗时，造成肠黏膜的损伤、肠道微生态环境的失调。此外一些诱因也是导致溃疡性结肠炎发作的一些原因，不洁的饮食或者不良嗜好都容易造成溃疡性结肠炎。