肾盂肾炎是由致病微生物引起的肾盂和肾实质炎症，常伴有下尿路感染。大多为革兰阴性杆菌感染所致，以大肠杆菌最常见。主要感染途径是上行性感染，即致病菌由尿道上行入膀胱引起膀胱炎，继而沿输尿管向上蔓延至肾脏，导致肾盂肾炎。少数患者的肾盂肾炎来源于血行感染，主要致病菌为金黄色葡萄球菌、沙门菌属、铜绿假单胞菌和念珠菌属。当肾脏结构受损或患有糖尿病、长期使用糖皮质激素和免疫制剂以及其他慢性消耗性疾病的患者，抵抗力下降，细菌易于由血流侵入肾脏，病变常为双侧性。