男性生殖器短小，不同的年龄治疗方法不同；1、对于儿童阴茎短小，需要去医院检查确诊，孩子是否是隐匿性阴茎，如果是这种情况，可以去泌尿外科做隐匿性阴茎矫正术，这样才能够切除限制阴茎发育的增生白膜延长阴茎。2、对于青春期阴茎短小患者，检查确诊是否是包皮过长或者包茎而引起的，可以行包皮或者包茎手术治疗，让阴茎正常发育。3、如果成年以后，有阴茎短小的现象，可以采用手术治疗法，比如阴茎延长术，或者阴茎假体植入术等。