现在医学界比较公认的三叉神经痛的原因是：有异常扭曲的血管，压迫了在脑桥走行的三叉神经或者三叉神经的后根，使它产生了局部脱髓鞘变化，脱失了髓鞘的感觉神经的轴突，与相邻的神经纤维发生了短路，轻微的触觉刺激，即可通过短路传入中枢，从而导致了疼痛的发作。上面是原发性三叉神经痛的病因。至于继发性的三叉神经痛，一般都有明确的原因，比如：颅底的肿瘤、转移瘤、脑膜炎、脑干的梗死、多发性硬化。因为这些病变，损害了三叉神经感觉根、髓内的感觉核、邻近的结构，所以导致了疼痛。