自身免疫性甲状腺炎导致脱发的治疗是使用甲状腺激素替代治疗，来缓解患者出现脱发的情况。自身免疫性甲状腺炎又叫桥本氏甲状腺炎，自身免疫性甲状腺炎可以导致甲状腺功能亢进症，也可导致甲状腺功能减退。所以当患有自身免疫性甲状腺炎的情况之下，应该进行甲状腺激素水平的测定。根据化验结果评定甲状腺功能状态，根据甲功的水平进行相关的药物治疗。如果出现了甲状腺功能亢进，那么需要使用抗甲亢的药物进行治疗。如果出现甲状腺功能减退则需要使用左甲状腺激素进行激素替代治疗。