胃肠炎的治疗主要是抗感染治疗、补充液体、补充丢失的电解质，并且纠正酸碱失衡。在选择抗感染药物治疗时，需要根据疾病的原因合理选择，也可以根据细菌培养以及药物的敏感试验结果，选择抗生素。在上述结果没有出来之前，可以根据经验合理选择。液体的补充、电解质的补充，需要根据血气分析以及电解质检查结果补充，可以促进疾病的恢复。在急性发作期需要调整饮食结构，需要少食多餐，增加容易消化吸收食物的摄入量。