龟头部位长水疱比较常见的是发生于龟头部位的生殖器疱疹。这是一种性传播疾病，主要是通过不洁的性接触性感染上单纯疱疹病毒。疱疹病毒导致局部皮肤的病变，会形成局部群集性的水疱，同时会有瘙痒或者是灼热，疼痛的感觉。初次感染一般症状比较重，之后病毒会在局部潜伏，当机体免疫力下降的时候，疱疹会再次的复发。另外还有些其他的疾病，比如固定性药疹或者是多形红斑等，也有可能出现龟头部水疱的表现。