少数肛周脓肿用抗生素，热水坐浴及局部理疗等可以消散，但多数需要手术治疗，手术方式因脓肿部位不同而异。 1.肛门周围脓肿切开引流术在局麻下就可进行，在波动最明显处作与肛门存放射状切口，保证引流通畅。 2.坐骨肛管间隙脓肿要在腰麻或骶麻下进行，在压痛最明显处用粗针头穿刺，抽出脓液后，在该处作一平行于肛缘的弧形切口，避免损伤括约肌，探查脓腔使引流通畅后，置管或油纱条引流。 3.骨盆直肠间隙脓肿切开引流术要在腰麻或骶麻下进行，切开部位因脓肿来源不同而不同。如脓肿向肠腔突出，手指在直肠内可触及波动，应在肛镜下行相应部位直肠壁切开引流；如脓肿源于经括约肌肛瘘感染者，引流方式与坐骨肛管间隙脓肿相似。 肛周脓肿切开引流后，绝大多数形成肛瘘。近年来有采用脓肿切开引流加一期挂线术的报道，可避免肛瘘的形成。