肛门尖锐湿疣的治疗需要考虑疣体的数量、大小、疣体位置，来综合采取治疗方法，具体有以下几种：第一、如果要是疣体比较小而且数量不多的情况下，可以考虑外涂药来治疗，比如斑蝥素乳膏、鬼臼毒素或者是派特灵；第二、如果要是疣体的数量比较多或疣体比较大的话，还是建议采取物理治疗方法，比如高频电刀、微波，或激光、手术方法来去除，原则上就是尽快去除疣体，因为病毒感染的疣体也仍然有传染性，还在不断变大，还在把病毒往周围播散，容易导致疣体越长越多，去除疣体以后只是第一步治疗，下一步还得需要减少局部病毒。在去除疣体伤口长好了以后，可以考虑用外用药的方法或者是做光动力的方法，来帮助减少黏膜里面藏着的病毒，减少复发。少数患者湿疣会长到肛内、长到肛管，这个时候就要用肛镜把肛门打开以后，把里面的疣体去掉，去掉以后，后期肛内也可以配合光动力治疗，或者是上药治疗方法。不管是哪个部位的湿疣，治疗起来都是两步，第一步是把疣体去除掉，第二步是减少局部病毒来减少复发。除了刚才说的方法以外，还可以配合使用增强免疫力的方法，加强身体对病毒的免疫的能力。比如可以考虑口服胸腺肽、匹多莫德转移因子，或使用注射胸腺肽或干扰素等方法。