导致龟头疼痛的原因，一般与泌尿系结石、尿道炎，包皮龟头炎、前列腺炎等疾病有关。泌尿系结石由于结石向下移动，当结石卡在尿道外口处，会出现龟头疼痛；尿道炎；患者有不洁性生活史导致淋球菌感染，会出现尿道口红肿、疼痛；包皮龟头炎；不注意个人卫生，长期受包皮垢和尿液的刺激，会出现龟头发炎、化脓，导致龟头疼痛；前列腺炎，炎症的刺激，反射性的引起龟头疼痛。