大多与患者的遗传背景，饮食结构和生活方式均有关系，但是具体的原因并没有研究得十分清楚。小肠间质瘤是指的是肠道粘膜的下层与肌层之间的间质细胞出现了异常。这种疾病很容易被误诊为胃肠道的其他疾病，名称好像是个良性的疾病，但是实际上是一种恶性肿瘤。它会破坏正常的肠道组织，并且有远处转移的风险，如果能早期发现，还是建议进行手术治疗，如果发展到了晚期，治疗的效果也比较差。