经常低烧头痛的原因很多，分为引起低烧的原因和引起头痛的原因。低烧的原因很多，可能是感冒，肺部感染、支气管炎、尿路感染、消化系统感染、肺结核、伤寒、亚急性甲状腺炎等。而头痛的原因则有偏头痛、紧张性头痛、神经性头痛、没休息好、颅内占位、颅脑血管疾病等。出现了这种情况，需要去医院查血常规、C反应蛋白、胸部CT、头颅CT、腹部CT等，明确诊断后积极治疗。