尿路感染反复发作的原因通常是新发感染，并非同一种感染再次发作。对于女性可预防性地进行抗生素治疗；男性通常是前列腺炎的征兆，慢性前列腺炎治疗难度较大，患有复发性感染的男性，通常还需要做后续检查。在使用药物期间，需要严格按照医生指导，避免擅自停药。因为大多数人群，在刚开始服药后很快就会感觉好转，如果症状稍有改善就停药，感染就可能会复发，而且服用抗生素不充分，也可能会促使细菌对抗生素产生耐药，抗生素耐药也会直接会降低抗生素的药效，并导致尿路感染更加难以治疗。