早上存在尿痛很有可能是泌尿系感染或尿路结石等因素引起的，最常见的原因还是泌尿系感染，因为泌尿系感染会导致患者尿路刺激症状，不但会出现尿痛，还有可能出现尿频，尿急，排尿时尿道烧灼感。患者要在正规医院泌尿外科就诊检查尿常规，必要的时候要进行尿培养检查，判断是哪种细菌感染引起，如果尿常规提示尿液当中白细胞或者中性粒细胞酯酶阳性，可以经验性使用喹诺酮类抗生素或者头孢类抗生素进行治疗，喹诺酮类抗生素可以选择左氧氟沙星，诺氟沙星或者环丙沙星，头孢类抗生素可以选择头孢克肟，头孢地尼。而尿路结石由于结石在体内会出现一定移行，在移行过程当中会对组织造成一定刺激引起炎症反应，甚至引起出血，在临床可能会表现为尿频、尿急、尿痛，甚至血尿，患者可以进行影像学检查，然后决定是采用保守药物排石还是手术排石。以上方案仅供参考，具体药品使用请结合自身情况在专业医生指导下用药。