对于双侧有卵巢囊肿的女性如果囊肿特别小，又没有任何的不适症状，那往往就不需要做任何的处理治疗。而是定期复查彩超看囊肿的增大变化情况即可，因为很多女性在排卵以后就可能会出现生理性的卵巢囊肿，这类卵巢囊肿比较小，同时又不会对身体造成伤害，所以就没有必要进行治疗。但如果女性检查彩超以后是出现双侧的卵巢巧克力囊肿，而且巧克力囊肿已经超过5cm，同时还有严重的痛经表现，也不能够正常自然怀孕。那就需要考虑住院做腹腔镜微创手术将双侧的卵巢囊肿切除。